Responsable : Christophe THIRIET
Nous étudions la dynamique de la chromatine dans le cadre de la réplication chez le myxomycète Physarum polycephalum.
Notre équipe utilise les caractéristiques uniques du myxomycète Physarum polycephalum, communément connu sous le nom de Blob, afin d’étudier la dynamique de la chromatine lors de la réplication. En effet, ce modèle original présente une synchronie parfaite de plusieurs centaines de millions de noyaux contenus dans une cellule géante appelée plasmode. De plus, le Blob a la capacité d’internaliser et d’utiliser des protéines exogènes. Depuis plusieurs années, nous avons étudié les régions des histones nécessaires au transport nucléaire et à l’assemblage en chromatine pendant la phase S du cycle cellulaire. Grâce à l’accès au génome de Physarum depuis 2016, nous développons à présent des approches de génomique – notamment de CUT&RUN – afin d’analyser le rétablissement de la structure de la chromatine après réplication de l’ADN. Nous avons également initié des approches génétiques chez Physarum, aucun outil ou ressource génétique n’étant disponible à ce jour. Notre but est d’être en mesure de transformer Physarum sous sa forme diploïde par les techniques de biolistique. Enfin, outre nos travaux chez Physarum, nous menons des approches biochimiques afin de définir in vitro les altérations de la structure d’un modèle de chromatine sous l’influence de l’histone centromérique CENP-A.
Mots-clés : chromatine, épigénétique, histones, modifications post-traductionnelles, physarum, transgénèse
Membres
Anciens membres de l'équipe
Projets
Publications
1 publication
International Journal of Molecular Sciences, 22 (3), 2021, ISSN: 1422-0067. |
1 publication
Genome Biology, 20 (1), p. 127, 2019, ISSN: 1474-760X. |
1 publication
Nuclear Dynamics at Specific Cell Cycle Stages in the Slime Mold emphPhysarum polycephalum incollection Lavelle, Christophe; Victor, Jean-Marc (Ed.): Nuclear Architecture and Dynamics, 2 , p. 557 - 567, Academic Press, Boston, 2018, ISSN: 25425358. |
3 publications
Scientific Reports, 7 (1), p. 1–10, 2017, ISSN: 20452322. |
Physarum polycephalum for Studying the Function of Histone Modifications In Vivo. Article Methods in molecular biology (Clifton, N.J.), 1528 , p. 245–256, 2017, ISSN: 1940-6029 (Electronic). |
Scientific Reports, 7 (1), p. 1–9, 2017, ISSN: 20452322. |
1 publication
Nucleosome Dancing at the Tempo of Histone Tail Acetylation Article Genes (Basel), 6 (3), p. 607-21, 2015. |