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Epigénomique des microalgues et interactions avec l'environnement
Epigénomique des microalgues et interactions avec l'environnement

Responsable: Leila Tirichine-Delacour (DR CNRS)

Membres: Agnès Sebart-Groisillier (IR CNRS), Xue Zhao (Doctorante CSC), Antoine Hoguin (Doctorant, IBENS)


Les microalgues sont à la base de la chaîne alimentaire de l’écosystème marin. Elles jouent un rôle primordial dans l’équilibre de notre planète grâce à leur fonction de photosynthèse qui fait d’elle le premier producteur d’oxygène et un véritable puits de carbone. Au-delà de leur importance écologique, elles représentent une source importante de composés bioactifs utilisés dans les industries pharmaceutiques, agroalimentaires, cosmétiques et de l’énergie.

Malgré leur importance écologique et économique, les bases moléculaires impliquées dans la réponse des microalgues à leur environnement et l’impact des changements que connaît notre planète sur leur devenir et évolution sont très peu connus. Nous étudions les mécanismes moléculaires en particulier épigénétiques, notamment la méthylation de l’ADN et les modifications post-traductionnelles des histones impliquées dans la réponse des micro-algues aux facteurs biotiques et abiotiques de l’environnement. Nous utilisons des approches multi-échelles, de la cellule entière/génome aux gènes, combinées à de la bioinformatique intégrative pour comprendre la biologie des modèles/systèmes étudiés en tant qu’entité et dans un contexte plus globale. Nous nous intéressons plus particulièrement à un groupe dominant des micro-algues, les diatomées et utilisons des espèces modèles ainsi que des approches moléculaires pluridisciplinaires pour comprendre comment les diatomées répondent aux contraintes biotiques et abiotiques des océans actuels. Nous utilisons des espèces modèles et non modèles pour étudier les interactions des diatomées avec les bactéries en particulier de type diazotrophe.

DAPI stained nuclei of Phaeodactylum tricornutum
DAPI stained nuclei of
Phaeodactylum tricornutum
Chaetoceros sp.
Chaetoceros sp.
Diatoms rich fraction sampled in the boothbay
Diatoms rich fraction sampled
in the boothbay of Maine (USA)
Ditylum sp.
Ditylum sp.
Guinardia sp.
Guinardia sp.
Epigenome browser.
P. tricornutum epigenome browser (cliquer pour agrandir)